Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab4aP56371 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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