Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcd1P48410 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcd1P48410 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms