Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdf5P43027 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms