Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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