Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms