Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vcam1P29533 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vcam1P29533 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms