Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprmP28828 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprmP28828 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtprmP28828 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms