Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd10P28359 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Hoxd10P28359 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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