Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms