Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pde6aP27664 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pde6aP27664 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pde6aP27664 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms