Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CftrP26361 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CftrP26361 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CftrP26361 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CftrP26361 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CftrP26361 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CftrP26361 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CftrP26361 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CftrP26361 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CftrP26361 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CftrP26361 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CftrP26361 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CftrP26361 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CftrP26361 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CftrP26361 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CftrP26361 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CftrP26361 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CftrP26361 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CftrP26361 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CftrP26361 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CftrP26361 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms