Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd8P23463 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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