Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ntf3P20181 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms