Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb1P14733 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmnb1P14733 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms