Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms