Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
UbbP0CG49 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms