Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna4P07351 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms