Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Ccl20O89093 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl20O89093 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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