Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lnx1O70263 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lnx1O70263 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms