Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ldb2O55203 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ldb2O55203 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ldb2O55203 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ldb2O55203 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ldb2O55203 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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