Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SlkO54988 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SlkO54988 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlkO54988 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlkO54988 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms