Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfrsf11aO35305 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfrsf11aO35305 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf11aO35305 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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