Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms