Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
MttpO08601 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MttpO08601 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms