Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3278L7N2D2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms