Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm20939L7N243 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm20939L7N243 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm20939L7N243 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm20939L7N243 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm20939L7N243 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20939L7N243 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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