Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms