Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ms4a18J3QN01 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ms4a18J3QN01 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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