Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Zfp408H7BX78 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Zfp408H7BX78 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp408H7BX78 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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