Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm20705-201ENSMUST00000177278 1921 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Msh4-203ENSMUST00000188338 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Prpf6-201ENSMUST00000002529 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Dgkd-201ENSMUST00000027517 5695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms