Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddx60E9PZQ1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ddx60E9PZQ1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ddx60E9PZQ1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ddx60E9PZQ1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ddx60E9PZQ1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Ddx60E9PZQ1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddx60E9PZQ1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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