Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms