Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rd3lB2RV38 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms