Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcc8B2RUS7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms