Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms