Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frmpd4A2AFR3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms