Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itgb4A2A863 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb4A2A863 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms