Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc194A0A140LIT1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ccdc194A0A140LIT1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ccdc194A0A140LIT1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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