Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRI3

Cfap77, Cilia and flagella-associated protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap77A0A087WRI3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cfap77A0A087WRI3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms