Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Top3bQ9Z321 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Top3bQ9Z321 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Top3bQ9Z321 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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