Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms