Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms