Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cldn13Q9Z0S4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn13Q9Z0S4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms