Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek3Q9R0A5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek3Q9R0A5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek3Q9R0A5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek3Q9R0A5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek3Q9R0A5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek3Q9R0A5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nek3Q9R0A5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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