Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Rnf4Q9QZS2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Rnf4Q9QZS2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Rnf4Q9QZS2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf4Q9QZS2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Rnf4Q9QZS2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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