Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a3Q9QZS0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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