Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ercc4Q9QZD4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ercc4Q9QZD4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ercc4Q9QZD4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ercc4Q9QZD4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ercc4Q9QZD4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ercc4Q9QZD4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ercc4Q9QZD4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ercc4Q9QZD4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ercc4Q9QZD4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ercc4Q9QZD4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ercc4Q9QZD4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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