Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms