Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Col5a3Q9JLI2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Col5a3Q9JLI2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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