Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms